hjc黄金城生物分析部提供全麵符合FDA/OECD/CFDA GLP的生物分析服務,以支持小分子藥物、生物製劑、疫苗和PD生物標記物的篩選與開發,及其臨床前研究和臨床研究。
hjc黄金城分子生物學服務項目
質粒製備(準備)
亞克隆
ORF克隆
基因突變
分子診斷
質粒構建服務流程
質粒構建過程
1、引物設計
2、目的片段選取:RNA提取、RNA反轉錄、PCR擴增、PCR產物純化
3、雙酶切
4、連接:1)雙酶切後,可將質粒酶切產物瓊脂糖電泳1-2ul;2)酶切產物液相純化;3)20ul連接體係
5、轉化
6、菌落PCR
7、測序:1)搖菌;2)送樣; 3)比對 ;
8、菌種保存:菌種比對成功,則可保存菌種備用。
9、質粒提取:菌種比對成功,凍存菌種後,菌液用於提取質粒。
一、基本原理
分、切、連、轉、篩
1、分:分離出要克隆的目的基因及載體。
2、切:用限製性內切酶切割目的基因和載體,使其產生便於連接的末端。
限製性內切酶:是一類能識別雙鏈DNA中特定堿基順序的核酸水解酶。
限製性核酸內切酶根據識別切割特性,催化條件及是否具有修飾酶活性分為三大類。
其中Ⅱ型酶能識別雙鏈DNA的特異順序,並在這個順序內切割,產生特異性DNA片段。時DNA重組技術中常用的酶。
Ⅰ型酶:具有修飾和切割功能,無固定切割位點
Ⅲ型酶與Ⅰ型類似,能識別特異位點,但切割位點在識別位點以外
Ⅱ型酶特點:
①識別順序一般為4-6個堿基對
②識別順序具有180度的旋轉對稱性,呈完全的回文結構
③Ⅱ型酶對雙鏈DNA兩條鏈同時切割,可產生兩種不同末端:平末端,粘末端
平末端:在識別順序的對稱軸上,對DNA同時切割形成平末端,如:SmaI
5’-CCC GGG-3’ 5’-CCC GGG-3’
3’-GGG CCC-5’ 3’-GGG CCC-5’
5′突出粘末端:在識別序列的兩側末端切割DNA雙鏈,於對稱軸的5 ′末端切割產生5 ′端突出的粘性末端,如:Hind Ⅲ
5’―AAGCTT―3’ 5’― A 5’-AGCTT―3’
3’―TTCGAA―5’ 3’― TTCGA-5’ A―5’
3′突出粘末端:與5′突出粘末端作用相反,產生3 ′端突出粘末端,如:PstI
5’―CTGCAG―3’ 5’―CTGCA-3’ G―3’
3’―GACGTC―5’ 3’―G 3’-ACGTC―5’
命名:酶來源的生物名稱縮寫
屬名-種名-株名-發現次序
根據其來源命名。如:EcoRI來源於大腸杆菌E.coli的RY13菌株,I指在該菌株中分離的第一個限製
酶活單位定義:在適當的條件下(T,pH,離子強度等)一小時內完全酶解1ug特定DNA底物所需要的限製性核酸內切酶的量,定義為1個活性單位。
目前常用的酶單位的定義是:37℃ ,1小時內50ul反應體係完全酶解1ugλ DNA所需的酶量。
在建立酶切體係時,酶的用量一般為1-5U/ugDNA。
3、連:將切割後的目的基因和載體用T4DNA連接酶連接。
①來源:T4DNA連接酶是T4噬菌體基因30編碼的產物。最早是從T4噬菌體感染的大腸杆菌中提取的。分子量為68KD,。
②最佳pH7.2-7.8,常用的反應液為pH7.6的Tris-Hcl
③需要ATP作為輔助因子並由ATP提供能量
④DTT等巰基化合物可促進連接酶的連接作用
⑤高濃度的鈉、鉀離子等抑製酶活性
4、轉:把連接好的重組載體轉化入感受態細胞的過程(細菌:E.coli,真菌:Yeast,昆蟲細胞或哺乳動物細胞)。
5、篩:在不同層次上、不同水平上進行篩選,鑒定所需的特異性重組子。使用各種方法,將帶有重組載體的宿主菌從培養基中篩選出來。例如:載體大小,酶切結果,篩選標記等。
二、操作步驟
①酶切產物回收
1. 將單一目的DNA條帶切下,放入幹淨的ep管中,稱取重量。
2. 向膠塊中加入3倍體積的溶膠液PN(如膠塊重量為100mg則加入300ul溶膠液PN),50℃水浴放置10min,間隔2min翻轉ep管數次,以確保膠塊充分溶解。
3. 膠塊完全溶解後,溶液降至室溫後將液體加入一個吸附柱(吸附柱放入收集管中),12000rpm離心30s,棄濾過液,將吸附柱重新放入收集管中。
4. 向吸附柱中加入700ul漂洗液PW,12000rpm離心30s,棄廢液,將吸附柱重新放入收集管中。
5. 向吸附柱中加入500ul漂洗液PW,12000rpm離心30s,棄廢液,將離心吸附柱放回收集管中,12000rpm離心2min。將吸附柱室溫放置5min徹底晾幹。
6. 將吸附柱放入一個幹淨的ep管中,向吸附膜中間位置懸空滴加30ul洗脫緩衝液EB,室溫放置2min,12000rpm離心1min。
②連接:連接體係一般為10-25ul,16℃連接過夜。
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